现代农业培训学院依托学校优质教育教学资源和社会资源办学，是福建农业职业技术学院高等学历继续教育、非学历培训和社会评价考试的管理服务部门。学院设有综合科、教务科、学籍科等内设科室，拥有一幢培训大楼，配备标准客房、多个培训（会议）专用教室以及多媒体教室、计算机房、电子阅览室等设施，还有可容纳300多人同时用餐的学员专用餐厅。
学院秉承“厚德强技、学以致用”的办学理念，致力于服务“三农”，以立德树人为核心，专注于培养适应现代农业和区域发展需求的高素质技术技能人才。自2013年起，学院被省农业农村厅、教育厅等部门选定为“新型职业农民素质提升工程大专学历教育”的培养机构，获农业部“首批全国新型职业农民培育示范基地”，“福建省省继续教育示范基地”，“福建省终身学习品牌项目”，“全国乡村振兴人才培养优质校”等称号。学院充分发挥其作为新型职业农民培育示范基地的作用，《以新型职业农民培育为抓手，活化乡村振兴人才队伍建设》入选教育部“职业教育助力乡村振兴研究”典型案例，《新型职业农民培育模式创新与实践》荣获福建省教学成果一等奖。学院开通了“福建新型职业农民教育培训网”，并创新性地打造了新型职业农民培育“341福建模式”，开办畜牧兽医、茶艺与茶文化、园艺技术（果蔬）、休闲农业经营与管理、市场营销、电子商务（农村电子商务）等多个实用技术专业，累计培育新型职业农民大专班学员8000余名。
近三年，学院还举办全省基层农技推广人员骨干培训班，每年培训基层农技骨干人员300多人；举办高素质农民省级示范培训班，每年培训农村新型主体带头人500多人。通过辐射推广，联合开展农民短期培训和新技术推广服务，带领周边农民共同致富，吸引中青年回归农村，形成引领示范协同发展的固农新格局，为福建“乡村振兴”和现代农业可持续发展，促进农业增效和农民增收，发挥了重要作用。